IBM正在与Coriell医学研究所合作,帮助生物库运行其低温冰柜的IT系统,并更好地管理450万个样本的个性化遗传数据。

类生命细胞最大的生物库。它运行CoriellPersonalizedMedicineCollaborative研究,旨在探索基因组知情的个性化医疗。

“我们可以从某人的基因构成中收集到大量信息,以帮助我们确定什么

生物银行寻求IBM的帮助Megill说,找到一种以非营利组织可以承受的方式管理数据的方法,同时保持大量数据。

从血培养物中提取的DNA存储多年。一个人的基因组相当于200万个数据点和大约1.5GB的信息,存储这么大量的数据是一个挑战。

“基因测试产生的大量数据是不像我们以前见过的任何东西,“梅吉尔说。”这对于一名患者来说几乎是一个太字节的信息。“我们确实有责任将良好的工具和基础设施放在适当位置,以便简单地使其具有可理解性。”

根据个体基因定制治疗方法可为治疗患者提供巨大潜力,例如:这些数据可以更好地为医生决定患者的决策提供信息。

IBM监控软件使Coriell能够保护其基因样本免受低温冷冻机故障的影响并使用IBMXIVStorage系统,它将存储成本降低了30%。

XIV是一个精简配置的网格存储平台,可按需分配空间,Megill指出。转向精简配置并使用XIV的网格模式允许Coriell显着减少了它消耗的存储空间。

“每个文件被分成非常小的块,然后均匀地分布在整个驱动器组中,而不是深入到驱动器中的几个驱动器上的文件。阵列,“梅吉尔解释道。“这意味着你可以使用速度更慢的旋转磁盘从XIV中获得相同的吞吐量,”他补充说,指的是标准的7,200-rpm驱动器。

“在传统的存储区域网络阵列中,你“你必须使用更快的旋转磁盘来实现相同的吞吐量,而且它们要贵得多,”他说。

同时,TivoliOmnibus和Netcool仪表板应用程序监控低温罐和冷冻柜中的服务器和数据库保持它们在合适的温度下正常运行。

“它们基本上从不同的地方收集数据,并在仪表板和警报中将它们拉在一起,这样我们就知道冰箱开始变得太热或者特定的Megill表示,我们的网络部分未达到可接受的阈值范围。

为了管理实验室的遗传数据,Coriell使用IBMWebSphereLombardiEditionBPM(业务流程管理)软件,现已集成到IBMBusiness中流程经理。

“Lombardi允许我们做什么要做的是直接与流程所有者合作,确定应用程序应该采用的方式,“我们真的无法在传统的编程方法中做到这一点,”Megill解释道。

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